Secara umum yoghurt mengandung setidaknya 1 sampai 3 jenis bakteri yang semuanya termasuk bakteri baik. Bakteri ini masuk jenis bakteri asam laktat. Bakteri yang paling sering terdapat pada yoghurt yaitu:
- Lactobacillus bulgaricus
- Lactobacillus acidophilus
- Streptococcus thermophilus
- Mengandung L. bulgaricus (LB) saja
- Mengandung L. acidophilus (LA) saja
- Mengandung S. thermophilus (ST) saja
- Kombinasi LB dan LA
- Kombinasi LB dan ST
- Kombinasi LA dan ST
- Kombinasi LB, LA dan ST
Cara terbaik mengetahui jenis bakteri asam laktat yang terkandung di yoghurt adalah dengan uji mikrobiologi di laboratorium.